南方醫(yī)科大學深圳醫(yī)院消化科以學科共建的形式，把國家臨床重點?？颇戏结t(yī)科大學南方醫(yī)院消化科優(yōu)勢技術移植到深圳醫(yī)院基地。按照大學附屬醫(yī)院和三甲醫(yī)院的高標準嚴要求建設與發(fā)展消化科。 　　目前除了能開展消化系統(tǒng)臨床常見病和危重病診療之外，已經開展了無痛胃腸鏡檢查、膠囊內鏡檢查、超聲內鏡檢查、胃腸道早期癌的篩查、胃腸息肉或早期癌的內鏡下治療（EMR、ESD）、消化道支架植入、消化道狹窄擴張術、食管胃的間質瘤治療（STED）、賁門失遲緩癥內鏡下治療（POEM）、胰膽管逆行造影與膽管取石（ERCP、ENBD）、雙氣囊小腸鏡檢查等高級內鏡下的診療技術。