北京昌平縣醫(yī)院的前身“昌平縣大眾醫(yī)藥社”于1946年在長(zhǎng)陵鄉(xiāng)上口村成立，1948年12月12日隨縣政府遷至昌平縣城。1949年3月“昌平縣大眾醫(yī)藥社”改稱為“昌平縣衛(wèi)生院”。1956年“昌平縣衛(wèi)生院”改稱為“昌平區(qū)衛(wèi)生院”，同年秋后遷至昌平鎮(zhèn)和平街4號(hào)（現(xiàn)在院址）。1957年12月27日“昌平縣衛(wèi)生院”升為“昌平區(qū)醫(yī)院”，1960年1月，“昌平區(qū)醫(yī)院”改稱為“昌平縣醫(yī)院”。