外科為以中醫(yī)、西醫(yī)及中西醫(yī)結(jié)合為特色的科室，綜合運(yùn)用中醫(yī)、西醫(yī)、中西醫(yī)結(jié)合等手段，治療外科各種常見病、多發(fā)病及各種疑難雜癥。在老一輩醫(yī)務(wù)人員的辛勤努力下，對(duì)脈管炎、靜脈炎、膽囊炎、膽石癥、乳腺及甲狀腺等疾病取得了豐富的治療經(jīng)驗(yàn)，并曾獲的衛(wèi)生部乙級(jí)成果獎(jiǎng)、中醫(yī)研究院科技進(jìn)步獎(jiǎng)。科室專家擔(dān)任北京中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)諸專業(yè)委員會(huì)主任委員等職。隨著外科學(xué)術(shù)的不斷進(jìn)步及業(yè)務(wù)廣泛拓展，目前外科設(shè)有多個(gè)學(xué)術(shù)專業(yè)組：血管外科組、乳腺與內(nèi)分泌外科組、疝與腹壁外科組、胃腸外科組及肝膽外科組等。 血管外科利用脈管炎膠囊、靜脈炎膠囊等中醫(yī)中藥與西醫(yī)藥及各種手術(shù)結(jié)合，診治血栓閉塞性脈管炎、動(dòng)脈硬化閉塞癥、糖尿病足、下肢淺靜脈曲張及深靜脈瓣膜功能不全、下肢深靜脈血栓等，療效確切。乳腺與內(nèi)分泌外科利用通絡(luò)散結(jié)丸、癭瘤消膠囊等中醫(yī)中藥結(jié)合西醫(yī)藥及各種手術(shù)，規(guī)范化診治乳腺病及乳腺癌、甲狀腺瘤、結(jié)節(jié)性甲狀腺腫、甲亢、甲狀腺癌等各種良惡性甲狀腺疾病。疝與腹壁外科利用中醫(yī)中藥配合先進(jìn)的人工材料行各種無張力的疝和腹壁缺損的修補(bǔ)，創(chuàng)傷小，恢復(fù)快，療效好。 胃腸外科利用中醫(yī)中藥使各種胃腸手術(shù)，如各種腸梗阻手術(shù)、胃腸壞死穿孔手術(shù)、胃癌根治術(shù)、結(jié)腸癌根治術(shù)及直腸癌根治術(shù)等胃腸手術(shù)術(shù)后腸功能恢復(fù)快、腸屏障功能保護(hù)好。肝膽外科在利用中醫(yī)中藥的同時(shí)，結(jié)合現(xiàn)代醫(yī)學(xué)的各種先進(jìn)診療技術(shù)，廣泛開展膽囊結(jié)石、肝內(nèi)外膽管結(jié)石、膽管囊腫、肝囊腫及膿腫、膽囊炎、膽管炎、胰腺炎、膽囊癌、膽管癌、肝癌、胰腺癌等的中醫(yī)中藥、介入及各種根治手術(shù)的治療。此外，外科還開展普胸外科及腦外科常見病的診治，如肺癌、食道癌及顱腦創(chuàng)傷及各種顱內(nèi)血腫的診治等。中醫(yī)中藥診治癤癰、瘡瘍、丹毒、臁瘡等頗具特色。 外科除開設(shè)專家門診外，尚有“血管病瘡瘍”、“丹毒”、“乳腺病” 專題門診。