黃金華
主任醫(yī)師 教授
科主任
醫(yī)學影像科吳沛宏
主任醫(yī)師 教授
3.7
醫(yī)學影像科李立
主任醫(yī)師 教授
3.7
醫(yī)學影像科高飛
主任醫(yī)師
3.6
醫(yī)學影像科張福君
主任醫(yī)師 教授
3.6
醫(yī)學影像科范衛(wèi)君
主任醫(yī)師 教授
3.6
醫(yī)學影像科顧仰葵
主任醫(yī)師 副教授
3.6
醫(yī)學影像科趙明
主任醫(yī)師 教授
3.6
醫(yī)學影像科張嶸
主任醫(yī)師 副教授
3.5
醫(yī)學影像科謝傳淼
主任醫(yī)師
3.5
黃子林
主任醫(yī)師
3.5
醫(yī)學影像科張衛(wèi)東
主任醫(yī)師 副教授
3.5
腫瘤外科曹飛
主治醫(yī)師
3.5
醫(yī)學影像科沈露俊
副主任醫(yī)師
3.4
醫(yī)學影像科李旺
副主任醫(yī)師 副教授
3.4
醫(yī)學影像科田麗
副主任醫(yī)師
3.4
醫(yī)學影像科呂衍春
主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科伍堯泮
主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科沈靜嫻
主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科黃職妹
副主任醫(yī)師
3.3
李傳行
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科張亮
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科鄭列
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科阮超美
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科李貽卓
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科蔡培強
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科張?zhí)炱?/p>
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科呂寧
副主任醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科黎升
主治醫(yī)師
3.3
醫(yī)學影像科左孟軒
主治醫(yī)師
3.3
謝輝
醫(yī)師
3.2
醫(yī)學影像科鄭瑋
副主任醫(yī)師
3.1
醫(yī)學影像科江藝泉
主治醫(yī)師
3.0
醫(yī)學影像科林樂濤
副主任醫(yī)師
2.9
日常護理黃梅麗
護師
2.9
潛在結(jié)果框架(PotentialOutcomesFramework),又稱反事實框架(CounterfactualFramework),是因果推斷的核心理論之一,由DonaldRubin提出并發(fā)展。其核心思想是通過比較同一個體在不同干預下的潛在結(jié)果(如接受治療?vs.?未接受治療)來定義因果效應。??潛在結(jié)果框架的4個核心概念1.潛在結(jié)果(PotentialOutcomes)對每個個體,假設其在干預(如治療)下的結(jié)果記為?Y(1),在未干預下的結(jié)果記為Y(0)。例如:癌癥患者接受新藥治療后的生存時間Y(1)?vs.?未接受治療的生存時間Y(0)。?2.個體因果效應(IndividualCausalEffect)定義為?Y(1)?Y(0)。但現(xiàn)實中,同一個體無法同時經(jīng)歷兩種狀態(tài)(根本問題),因此需要依賴群體層面的統(tǒng)計推斷。?3.?平均因果效應(AverageCausalEffect,ACE)。在群體中比較平均結(jié)果差異:ACE=E[Y(1)?Y(0)]。例如:新藥組?vs.?對照組的平均生存期差異。?4.?可忽略性假設(Ignorability)干預分配與潛在結(jié)果獨立(即無混雜):(Y(1),Y(0))⊥T∣X,其中?X?是協(xié)變量(如年齡、癌癥分期等)。通過隨機化實驗或統(tǒng)計調(diào)整(如傾向得分匹配)滿足此假設。?潛在結(jié)果框架將因果問題轉(zhuǎn)化為可計算的潛在結(jié)果對比,避免混淆相關性與因果性。研究者通過設計(如隨機試驗)或統(tǒng)計方法(如雙重機器學習)控制混雜變量,從而估計無偏的因果效應。同時,該框架能夠幫助回答“如果做了這個治療(事實上沒做),結(jié)果會如何變化?”這類反事實問題,例如:“癌癥患者如果沒做A治療,改做B治療,能否延長生存期?”?在癌癥研究中,潛在結(jié)果框架協(xié)助設計臨床試驗,比較新藥與標準治療的潛在結(jié)果,從而確定療效(如總生存期、無進展生存期等)。此外,潛在結(jié)果框架能夠利用觀察性研究的數(shù)據(jù)進行因果推斷,利用工具變量以及雙重差分等方法逼近因果效應,從而輔助個性化、精準化的治療。?潛在結(jié)果框架的應用的挑戰(zhàn)框架最根本的問題在于反事實不可觀測性:對于同一個體,我們只能觀察到一種干預狀態(tài)下的結(jié)果(如接受治療或未接受治療),而另一種狀態(tài)的結(jié)果(反事實)永遠無法觀測。此外,可忽略性要求干預分配?T與潛在結(jié)果?Y(1),Y(0)?在給定協(xié)變量X的條件下獨立,即無未測量的混雜變量,所有影響干預和結(jié)果的變量均已觀測并調(diào)整。如,研究吸煙對肺癌的影響時,若未測量“遺傳風險”或“職業(yè)暴露”,則估計可能偏誤。在癌癥研究中,患者選擇特定治療可能受醫(yī)生主觀判斷(未記錄因素)影響。此外,當X?維度很高(如基因組數(shù)據(jù)),傳統(tǒng)方法(如回歸、匹配)可能失效,需依賴機器學習(如因果森林)。此外,還有很多挑戰(zhàn)需要應對。?總之,潛在結(jié)果框架為癌癥研究提供了嚴謹?shù)囊蚬治龉ぞ?,從臨床試驗設計到真實世界證據(jù)生成,幫助科學家區(qū)分“相關性”與“因果性”,最終優(yōu)化治療策略。
什么是c-index?C-index是一種用于評估生存分析模型預測能力的統(tǒng)計指標,也稱為判別指數(shù)或一致性指數(shù)。對于臨床醫(yī)生以及臨床科學家來講大家偏向喜歡c-index的原因如下:1)直觀性:C-index是一個易于理解的指標,可以直觀地反映模型在預測生存時間方面的準確性。與其他評估指標相比,例如MSE(均方誤差)等,C-index更符合生存分析的特殊需求。2)適用范圍廣:C-index不僅適用于各種類型的生存分析模型,例如Cox回歸、Kaplan-Meier曲線、深度學習模型等,而且可以評估多個預測因素的組合效果。3)魯棒性強:C-index對異常值不敏感,即使在存在極端值或缺失數(shù)據(jù)等情況下,其結(jié)果也通常具有較高的穩(wěn)定性和可靠性。4)易于計算和應用:C-index的計算方法簡單、易于實現(xiàn),并且可以很容易地與現(xiàn)有的生存分析軟件集成。如何評估總體c-index的結(jié)果?C-index小于0.5:模型的預測效果比隨機猜測還要差,說明該模型需要重新調(diào)整或選擇。C-index等于0.5:模型的預測效果與隨機猜測相當,說明該模型沒有預測價值。C-index介于0.5和0.7之間:模型的預測能力較弱,需要進一步改進。C-index介于0.7和0.8之間:模型的預測能力較好,但還有改進的余地。C-index大于0.8:模型的預測能力很強,可以用于實際應用中。C-index的數(shù)學表示是什么?C-index=(numberofconcordantpairs+0.5numberofties)/totalnumberofpairs其中,concordantpair是指模型正確預測較短生存時間的患者的事件發(fā)生時間早于較長生存時間的患者;tie是指兩個或多個患者具有相同的生存時間。totalnumberofpairs是所有可能的患者對數(shù)量。這個公式也可以寫成以下形式:C-index=(2AUC-1)其中,AUC是受試者工作特征曲線(ROC曲線)下的面積。什么是時間依賴性的c-index?時間依賴性(time-dependent)的C-index是一種對生存分析模型預測能力進行評估的指標,旨在解決傳統(tǒng)C-index中忽略了風險組成變化和隨時間改變的問題。與傳統(tǒng)C-index只考慮患者之間的事件順序不同,時間依賴性的C-index通過考慮患者的風險狀態(tài)的變化,將權重加在有風險的時段內(nèi),反映出模型在不同時間點上的預測準確性。在時間依賴性的C-index中,每個時刻都有一個獨立的C-index值,用于描述模型在該時刻下的預測精度。對所有時刻的C-index求平均可以得到整個觀察期的時間依賴性C-index。時間依賴性的C-index可以更準確地評估生存分析模型的預測能力,尤其適用于存在風險組成變化和需要動態(tài)時間序列分析的研究。時間依賴性的c-index與傳統(tǒng)的Harrel’sc-index有什么區(qū)別?1)考慮到時間依賴性:時間依賴性的C-index通過考慮患者的風險狀態(tài)的變化,將權重加在有風險的時段內(nèi),反映出模型在不同時間點上的預測準確性。而傳統(tǒng)的Harrel‘sC-index只考慮了患者之間的事件順序,沒有考慮到時間的影響。2)不需要比較基線風險函數(shù):在傳統(tǒng)的Harrel‘sC-index中,需要將模型的預測與基線風險函數(shù)進行比較,從而計算出預測準確性的指標。而在時間依賴性的C-index中,不需要使用基線風險函數(shù)進行比較。3)可以評估多個時間點:時間依賴性的C-index可以評估模型在多個時間點的預測準確性,而傳統(tǒng)的Harrel‘sC-index只能評估整個觀察期的預測準確性。4)等價于AUC:當權重函數(shù)為常數(shù)時,時間依賴性的C-index等價于受試者工作特征曲線(ROC曲線)下的面積(AUC),而傳統(tǒng)的Harrel‘sC-index并沒有這個等價性??傊?,時間依賴性的C-index是一種對生存數(shù)據(jù)預測準確性的擴展評估,相比傳統(tǒng)的Harrel‘sC-index具有更廣泛的適用范圍和更全面的反映模型預測能力的優(yōu)勢。時間依賴性c-index的數(shù)學表示是什么?時間依賴性的C-index可以表示為:C(t)=∑∑Wi,j[Yi(t)>Yj(t)]/∑∑Wi,j1.根據(jù)某個時間點t選出所有觀察時間大于等于t的患者組成集合R(t)。2.對于集合R(t)中任意兩個患者i和j,我們根據(jù)各自在時刻t處的預測風險分數(shù)Yi(t)和Yj(t)來確定他們之間的大小關系(即Yi(t)>Yj(t)或Yi(t)<Yj(t))。3.我們將每對患者之間的大小關系乘以一個權重W(i,j),然后將所有乘積相加得到分子。4.我們計算所有權重值的和作為分母。5.將分子除以分母得到時間點t的C-index值C(t)。其中,權重W(i,j)可以根據(jù)患者i和j的觀察時間、事件狀態(tài)、以及其他協(xié)變量的取值來計算。常見的權重函數(shù)有Efron‘sweight和Breslow‘sweight等,它們對患者之間的距離進行不同的度量,從而影響最終的C-index值。在整個觀察期內(nèi),我們可以計算出所有時間點的C(t)值并求平均以獲得最終的時間依賴性的C-index。如果模型的預測能力很強,則C-index值會接近于1;反之,如果模型的預測能力很差,則C-index值會接近于0.5(隨機猜測的情況)。硬核內(nèi)容:R中如何編碼c-index以及時間依賴性c-index的函數(shù)?#加載需要的包library(survival)library(rms)library(riskRegression)#數(shù)據(jù)變量重新命名dat<-SimSurv(100)status<-dat$eventtime<-dat$eventtimey<-cbind(time,status)#使用因素做Cox回歸并計算cindexX1<-dat$X1X2<-dat$X2#設置cph全局的數(shù)據(jù)集dd<-datadist(X1,X2)options(datadist=‘dd‘)S<-Surv(time,status)X1=as.factor(X1)dat$X1=as.factor(X1)#做兩個模型,并計算c-index,注意這個c-index需要1-cindex計算真實值f<-coxph(S~X1,x=T,y=T)k<-coxph(S~X1+X2,x=T,y=T)cox.zph(f)cox.zph(k)Cindex1<-rcorrcens(Surv(time,status)~predict(f,datadist=‘dd‘))Cindex2<-rcorrcens(Surv(time,status)~predict(k,datadist=‘dd‘))Cindex1Cindex2#另一種c-index,這種計算方法不需要1-cindexsum.surv<-summary(coxph(Surv(time,status)~X1+X2,data=dat))c_index<-sum.surv$concordance#做個時間相關性Roc,注意Surv(time,status)~1等于說是不含權重的,如果后面加協(xié)變量等于是加權A3<-riskRegression::Score(list(“f“=f),formula=Surv(time,status)~1,data=dat,metrics=“auc“,null.model=F,times=seq(3,16,1))plotAUC(A3)#把做出來的圖放到ggplot上作圖auc<-plotAUC(A3)ggplot()+geom_line(data=auc,aes(times,AUC),linetype=1,size=1,alpha=0.6,colour=“red“)+geom_ribbon(data=auc,aes(times,ymin=lower,ymax=upper),alpha=0.1,fill=“red“)+geom_hline(yintercept=1,linetype=2,size=1)+theme_classic()+labs(title=“time-depdentROC“,x=“times“,y=“AUC“)#對比f和k兩個模型的時間相關性rocA3<-riskRegression::Score(list(“f“=f,“k“=k),formula=Surv(time,status)~1,data=dat,metrics=“AUC“,null.model=F,times=seq(3,16,1))auc<-plotAUC(A3)ggplot()+geom_line(data=auc,aes(times,AUC,group=model,col=model))+geom_ribbon(data=auc,aes(times,ymin=lower,ymax=upper,fill=model),alpha=0.1)+geom_hline(yintercept=1,linetype=2,size=1)+theme_classic()+labs(title=“time-dependentROC“,x=“times“,y=“AUC“)#畫時間相關性c-index,先畫X1擬合的模型flibrary(pec)A1<-pec::cindex(list(“f“=f),formula=Surv(time,status)~X1,data=dat,#從第3-16個月,間隔1個月,評估c-index;每個點都采用在時間節(jié)點前出現(xiàn)結(jié)局的病例對eval.times=seq(3,16,1))plot(A1)#輸出time-dependentcindex的結(jié)果zzz=A1$AppCindex#畫f,k兩個模型的時間相關性c-indexA1<-pec::cindex(list(“f“=f,“k“=k),formula=Surv(time,status)~1,data=dat,eval.times=seq(3,16,1))plot(A1)
CT引導調(diào)針的熟練度對于進行安全、有效的消融至關重要。我們在調(diào)針過程中可以近似“定量”地通過判斷病灶的位置以及測量進針的深度來綜合判定進針的角度,這也是中山大學腫瘤防治中心微創(chuàng)介入科李旺教授傳授的技術。
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