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肺癌基因檢測(cè)野生型是什么意思?
在臨床上,我們說一個(gè)肺癌是“野生型(Wild-Type)”,通常指的是它沒有檢測(cè)到目前已知的、有成熟靶向藥的“明星”驅(qū)動(dòng)基因突變,如EGFR、ALK、ROS1、BRAFV600E、MET、RET等。但這絕對(duì)不等于它沒有基因突變。它仍然有導(dǎo)致其癌變的啟動(dòng)基因,只是那個(gè)基因可能:我們目前還不知道或不常規(guī)檢測(cè)。我們知道了,但暫時(shí)沒有有效的靶向藥(比如很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)的KRAS)。它是一個(gè)難以靶向的抑癌基因失活。可人類的基因圖譜不早就被完全測(cè)序了么?怎么還會(huì)有目前不知道的基因呢?我們要知道:"完成基因圖譜測(cè)序”和“完全理解基因功能”是兩個(gè)截然不同的概念。我們可以用一個(gè)形象的比喻來解釋這件事:人類基因組圖譜就像一本包含了所有漢字但不了解詳細(xì)含義的《字典》。2003年,科學(xué)家宣布完成了人類基因組計(jì)劃,這相當(dāng)于我們成功地編纂出了這本《字典》。我們知道了人類大約有2萬多個(gè)“字”(蛋白質(zhì)編碼基因),并且知道了每一個(gè)“字”的筆畫順序(DNA序列)。這是一個(gè)里程碑式的成就。但是,初學(xué)認(rèn)字者僅僅擁有一本字典,并不意味著能看懂《紅樓夢(mèng)》呢?。這就是我們目前的處境?!耙吧汀蹦[瘤中那些我們暫時(shí)不了解的驅(qū)動(dòng)基因,就是我們還未讀懂的《紅樓夢(mèng)》里的復(fù)雜章節(jié)。具體來說,差距體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.我們“認(rèn)全了字”,但遠(yuǎn)未“搞懂每個(gè)字的含義”字典的比喻:我們知道了字典里有“魑魅魍魎”這四個(gè)字,也知道它們的寫法。但很多人并不知道它們具體指什么,以及在什么語境下使用。生物學(xué)現(xiàn)實(shí):在約2萬個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因中,有相當(dāng)一部分的功能我們?nèi)匀徊磺宄蛘咧皇且恢虢?。這些基因被稱為“功能未知基因”(GenesofUnknownFunction)。一個(gè)“野生型”腺癌的驅(qū)動(dòng)突變,可能就發(fā)生在這類我們尚未充分研究的基因上。我們看到了序列變化(字寫錯(cuò)了),但因?yàn)椴焕斫膺@個(gè)字的作用,所以無法確定它就是導(dǎo)致癌癥的“罪魁禍?zhǔn)住薄?.問題不在于“字”本身,而在于“語法和標(biāo)點(diǎn)符號(hào)”——非編碼區(qū)字典的比喻:一篇文章的好壞,不只取決于用了哪些字,更取決于語法、語序和標(biāo)點(diǎn)符號(hào)。一句話里加個(gè)逗號(hào),或者改變?cè)~語的順序,意思可能天差地別。生物學(xué)現(xiàn)實(shí):人類基因組中,真正編碼蛋白質(zhì)的序列(外顯子,相當(dāng)于“字”)只占不到2%。剩下的98%是非編碼區(qū)(相當(dāng)于“語法和標(biāo)點(diǎn)”),包括內(nèi)含子、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等。過去我們以為這些是“垃圾DNA”,現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)它們是調(diào)控基因“何時(shí)表達(dá)、在哪表達(dá)、表達(dá)多少”的開關(guān)和旋鈕。一個(gè)癌癥的驅(qū)動(dòng)突變可能不在于編碼區(qū)(字沒寫錯(cuò)),而在于調(diào)控區(qū)(語法標(biāo)點(diǎn)錯(cuò)了)。比如,一個(gè)癌基因的“啟動(dòng)子”區(qū)域發(fā)生突變,導(dǎo)致這個(gè)基因被瘋狂轉(zhuǎn)錄,產(chǎn)量提高了100倍。這同樣是致癌的,但傳統(tǒng)的基因檢測(cè)往往只關(guān)注編碼區(qū),就可能會(huì)漏掉。3.重要的不是“一個(gè)詞”,而是“詞語間的復(fù)雜組合”——基因網(wǎng)絡(luò)字典的比喻:要理解一個(gè)復(fù)雜的概念,往往需要一整段話,甚至一整篇文章來解釋,而不是一個(gè)孤立的詞。生物學(xué)現(xiàn)實(shí):癌癥很少是單基因事件。它往往是一個(gè)信號(hào)通路(一個(gè)基因團(tuán)隊(duì))的集體淪陷。也許一個(gè)“野生型”腫瘤里,沒有一個(gè)基因發(fā)生“明星級(jí)”的突變,但PI3K通路上的A基因突變了一點(diǎn),B基因突變了一點(diǎn),C基因又突變了一點(diǎn)……每一個(gè)突變單獨(dú)看都不起眼,但它們組合在一起,就共同構(gòu)成了強(qiáng)大的致癌驅(qū)動(dòng)力。要識(shí)別這種“團(tuán)隊(duì)作案”模式,比找到一個(gè)“明星罪犯”(如EGFR突變)要困難得多。4.除了基因突變,還有不改變DNA序列的“潛規(guī)則”——表觀遺傳學(xué)字典的比喻:想象一下,圖書館里所有的書(DNA)都是好的,字也沒錯(cuò)。但圖書管理員(表觀遺傳修飾)在一些關(guān)鍵的書上貼了“禁止閱讀”的標(biāo)簽(DNA甲基化),而在另一些書上貼了“優(yōu)先閱讀”的標(biāo)簽(組蛋白乙?;_@樣一來,雖然書的內(nèi)容沒變,但讀者能獲取的信息完全變了。生物學(xué)現(xiàn)實(shí):很多癌癥,尤其是那些找不到驅(qū)動(dòng)基因突變的“野生型”癌癥,其真正的元兇是表觀遺傳失調(diào)。比如,一個(gè)重要的抑癌基因(如TP53或RB1的同伴),它的DNA序列完全正常,但它的啟動(dòng)子區(qū)域被加上了“禁止閱讀”的甲基化標(biāo)簽,導(dǎo)致這個(gè)基因被沉默,無法生產(chǎn)出抑癌蛋白。其效果和基因突變是一樣的,但常規(guī)測(cè)序發(fā)現(xiàn)不了這種“標(biāo)簽”錯(cuò)誤。所以,當(dāng)我們?cè)谂R床上說一個(gè)腫瘤是“野生型”時(shí),更準(zhǔn)確的描述是:“在我們當(dāng)前常規(guī)檢測(cè)的、已知有明確靶向藥的、少數(shù)幾個(gè)關(guān)鍵基因上,沒有發(fā)現(xiàn)突變”。這絕不意味著它沒有驅(qū)動(dòng)基因。它的驅(qū)動(dòng)力可能隱藏在:一個(gè)我們尚未讀懂的“生僻字”里(功能未知基因)。一段被我們忽視的“標(biāo)點(diǎn)符號(hào)”里(非編碼區(qū)突變)。一個(gè)由多個(gè)“普通詞匯”組成的復(fù)雜句式里(通路共突變)?;蛘?,它根本就不是書寫錯(cuò)誤,而是貼錯(cuò)了“閱讀標(biāo)簽”(表觀遺傳修飾)。人類基因科學(xué)的現(xiàn)狀,就是從“認(rèn)字”階段,邁向了“閱讀理解和文學(xué)賞析”的深水區(qū)。而“野生型”腫瘤,正是擺在我們面前最難啃的“文學(xué)巨著”。作為以"開刀"為主業(yè)的外科醫(yī)生,在思考與實(shí)踐如何精準(zhǔn),安全,徹底切除腫瘤的同時(shí),學(xué)習(xí)分子生物,藥學(xué),內(nèi)科治療的進(jìn)展也是每日的必修課啊
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