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常染色體缺失的遺傳咨詢(十六)16號染色體缺失
16P染色體的重排是遺傳疾病中的常見現(xiàn)象之一。與近端15q一樣,16號染色體的近端短臂有進化意義。在靈長類物種形成過程中,是一個特別活躍的重排位點,且在智人時期積累了導致自閉癥的位點。這一區(qū)域的CNV與智力缺陷,特別是在精神病有關(guān)疾病中,起著重要作用。此外,BMI相關(guān)的生長指標及頭圍也與此處的CNV有關(guān)。該區(qū)域內(nèi)至少65個基因,眾多的基因?qū)е铝穗y以明確具體的致病基因。在16p11.2p12.2中有5個斷點(BP)區(qū)域,編號為1~5,從端粒到著絲粒(遠端到近端),可用此編號對不同的節(jié)段性失衡進行分類。這些不同片段的缺失,在表型上相似性很高。同樣,基因組中其他位置的CNV變異,可造成第2次(或第1次)打擊,有可能會加重臨床癥狀。(注:BMI即BMI指數(shù),系指身體質(zhì)量指數(shù),簡稱體質(zhì)指數(shù)),是目前國際上常用的衡量人體胖瘦程度以及是否健康的一個標準,BMI值是一個中立而可靠的指標)1.16p11.2缺失BP4~BP5(近端16p11.2缺失)發(fā)生該類缺失的頻率較高,導致了表型多樣性,在一個家系中,看到的幾乎是不同表型的患者。BP4和BP5在序列中有一個600kb的片段,是BP1~BP5區(qū)域內(nèi)最常見的不平衡重排。TBX6基因是重要的標志性基因,該基因的缺失導致了神經(jīng)心理學表現(xiàn),主要有智力障礙、癲癇、語言習得差,表現(xiàn)為兒童期語言障礙、笨拙和行為障礙。該缺失導致的臨床表現(xiàn),可能與典型孤獨癥非常相似(這是孤獨癥患者中最常見的CNV異常之一),但有些微小的差異。事實上,用基因型對其進行分類的方法診斷孤獨癥,更精確。該缺失患者大腦中的白質(zhì)束發(fā)育異常,導致了陣發(fā)性kine-sigenic運動障礙(PKD)。PKD是由突然運動觸發(fā)的身體姿勢異常,可能是PRRT2基因丟失導致的?;颊叽竽X皮層很薄(與微重復導致的小頭畸形相比),常見的表現(xiàn)是大頭畸形。總的來說,大腦尺寸的增加與某些大腦區(qū)域的增加有關(guān),反映了神經(jīng)發(fā)育異常。特殊的畸形是Chiari小腦缺損。BMI增加會有明顯肥胖,這可能是神經(jīng)激勵途徑異常,導致食欲過度所致。該缺失攜帶者可能出現(xiàn)或不出現(xiàn)輕微的畸形。缺失一般是新發(fā)變異,也可以是由遺傳而來。在家系中,表型更異常的外顯率為47%。伴隨的第2次打擊可能會加重表型。2.16p11.2缺失?BP2~BP3(16p11.2遠端)缺失在BP2和BP3之間,有一個220kb的短小缺失。SH2B1基因的單倍劑量不足,是嚴重早發(fā)性肥胖的致病原因。其表型包括智力缺陷、行為困難、輕度面部畸形以及肥胖。該缺失也與精神分裂癥有關(guān)。外顯率很高,為62%。該缺失通常是遺傳性的。3.16p12.2p11.2缺失?從BP1到~BP5。8Mb大片段的缺失與智力殘疾、嚴重的語言發(fā)育遲緩和畸形特征有關(guān)。復發(fā)性耳部感染是由于OTOA基因缺失造成的。OTOA與BP1重疊,偶爾也出現(xiàn)心缺陷和身材矮小。估計外顯率為62%。16p11.2p12.2內(nèi)缺失的異質(zhì)性,會有更大些的缺失,可能從BP1延伸至BP5,或超過BP5;一些可能只僅限于BP3~BP5內(nèi)。4.16p12.2缺失?該處有一個重復性的520kKb缺失,導致了神經(jīng)精神疾病的表型,且極易受基因組中其他位置CNV變異的第2次打擊,加重了對表型效應,有二次打擊的CNV變異在病例中的頻率為24%,比對照組的0.4%高很多。如果本身有精神分裂癥的風險,對這種缺失者就是一次失衡打擊,從而增加該疾病的風險;還可能并發(fā)輕微的顱面異常。該片段內(nèi)只有3個基因,CDR2、EEF2K和UQCRC2,后者與自閉癥有關(guān)。該缺失多由父母遺傳;父母攜帶者可能有學習困難和精神障礙,如抑郁癥或雙相情感障礙,但比他或她受累計后代的表型,要輕些。偶爾也有新發(fā)變異的病例。5.16p13.11缺失?通過微陣列芯片分析,發(fā)現(xiàn)了5名患者有這種缺失,并首先從基因型水平是對其進行了確認。該缺失與精神發(fā)育遲滯、小頭畸形以及一些患者的身材矮小、唇裂和其他中線缺陷有關(guān),也與癲癇有特殊的關(guān)聯(lián)性。典型的缺失大小為1.65Mb,至少包括15個基因,其中NTAN1和NDE是候選的致病基因;MYH11基因是另一個標志性位點。有人描述了出現(xiàn)嚴重的大腦結(jié)構(gòu)缺陷的病例,發(fā)現(xiàn)缺失的另一條16號染色體上的NDE1等位基因發(fā)生了突變。相反,有人報道,在2個學習能力正常的成年人腦組織中,并沒有發(fā)現(xiàn)組織水平的異常,但他們都有該區(qū)域的小缺失,該小片段中就包含了NDE1基因。6.16pl3.3缺失?此處重點是α-地中海貧血和智力低下,這是α地中海貧血和精神發(fā)育遲滯(ATR)綜合征之一。在16p缺失ATR綜合征中,染色體最末端的片段是單體狀態(tài),其中至少包括α珠蛋白位點。前些年,地中海貧血的臨床表現(xiàn)是診斷關(guān)鍵,如今可用微陣列的基因組缺失進行診斷。缺失的大小各不相同,較小的缺失片段從0.3到1Mb,臨床上可能沒有明顯的認知障礙,但從1Mb到2Mb范圍內(nèi)的缺失,通常會導致臨床表現(xiàn)。更大的缺失(往近端延伸至少2Mb以上)導致了更廣泛的臨床表型,可能包括結(jié)節(jié)性硬化和多囊腎(TSC2基因及PKD1基因),趕上甚至超過ATR綜合征的臨床表型。一般是新發(fā)變異,但父母有重排者也不罕見。7.16p13.3缺失?即Rubinstein-Taybi綜合征(RTS),有獨特的表型,其面容及大拇指特征非常明顯。大多數(shù)病例是由于基因點突變導致,但大約10%~25%的患者是由于一個小片段(l~15kb)的缺失導致。該缺失使CREBBP基因部分或者全部丟失。在有或沒有微缺失的RTS患者之間,表型并無明顯差異,這表明鄰近基因可能沒有劑量敏感性。臨床觀察到的嚴重程度的大小,反映了異常基因表達的可變性;單卵雙生子的RTS患者,有相當不同的神經(jīng)行為表型,支持了這一理論。8.16ql2缺失這是一罕見的綜合征,缺失長度為2.6至6.9Mb,是關(guān)鍵基因SALL1丟失。該缺失導致Townes-Brock綜合征的輕微表型,其他有中度到重度發(fā)育延遲,可能是還有其他基因的丟失。更長的缺失可延伸到16q12.1q12.2,該片段代表性的基因是ZNF423和FTO,可導致更嚴重的綜合征。9.16q21q22.1缺失該缺失在出生前和出生后都有生長遲緩、小頭畸形,精神運動遲緩和面部畸形。最小缺失為0.27Mb;HSD11B2基因缺失可能是生長遲緩的原因。值得注意的是,位于著絲粒的重疊區(qū)域缺失后,對表型沒有任何影響;這是“常染色突變體”,說明16q21這一段的基因密度非常低。10.16q23缺失該區(qū)域最小缺失的病例是一個5歲自閉癥(無畸形)女孩。有人提出是CMIP基因的作用,它是僅有的2個丟失基因之一。重排是新發(fā)突變。有人發(fā)現(xiàn)了一個更大區(qū)域的缺失,與腎鈣化、精神運動延遲、異常頭骨形狀(三角頭畸形)、以及門靜脈和下腔靜脈之間,繞過肝的異常血管連接(經(jīng)口分流術(shù))等相關(guān)。11.16q24缺失?有3種獨立或部分重疊的綜合征都涉及16q24區(qū)段。(1)首先:16q24.1缺失綜合征有神經(jīng)認知缺陷,也可根據(jù)缺失區(qū)域預測某些器官畸形,包括嚴重且通常致命的肺疾病、肺泡毛細血管發(fā)育不良、尿路梗阻引起的雙側(cè)腎積水、心與腸道畸形。在大多數(shù)情況下,缺失的大小從100kb到2Mb;也有一些更大片段的缺失。FOXF1是核心表型的眾多候選基因中,最關(guān)鍵的致病基因。該區(qū)域的缺失都是新發(fā)變異。目前,只有1例遺傳性的報道,是一個正常母親,有131kb缺失(不包括FOXF1);這病例可能反映了該區(qū)域有親本印記,其中的解釋很復雜。這種綜合征提示,基因單倍劑量不足可以不致病,但基因遠處增強子的單倍劑量不足可以致疾病。這表明,F(xiàn)OXF1上游增強子缺失時,F(xiàn)OXF1基因本身(大約272kb遠)卻保持完整,但仍可能導致了基因的功能性不表達,從而導致典型的肺部疾病。(2)其次:16q24.2缺失與孤獨癥及嚴重的智力障礙,以及輕微的顱面畸形相關(guān)。該缺失主要局限于16q24.2區(qū)域,大小從27kb到2.7Mb不等。其中一個包含的基因FBXO31是神經(jīng)行為表型的關(guān)鍵因素;當缺失延伸到16q24.3區(qū)域時,會涉及另一個基因ANKRD11。延伸至16q24.1的缺失,可能與尿路疾病有關(guān),但在某些局限于16q24.2缺失的病例中,也可見到該缺失。缺失的大小小于1Mb時,多數(shù)是父母遺傳的,也有母親是缺失嵌合體的報道。(3)最后:16q24.3的缺失導致一種綜合征,其中智力殘疾、輕微面部異常、巨齒畸形和身材矮小是典型的表型。缺失片段最大可達2Mb。ANKRD11(以及導致KBG綜合征的基因)基因的缺失,是主要因素;鄰近基因的缺失則進一步擴展了表型范圍。???根據(jù)《染色體異常與遺傳咨詢》
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月29日1110
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常染色體缺失的遺傳咨詢(十五)15號染色體缺失
作為智人,我們是進化的受害者,至少在15q近端缺失方面如此。15q11.2q13.3區(qū)域是“最近”(大約不到100萬年前)嵌入了重組片段,這些片段容易誘發(fā)非等位同源重組。令人感興趣的有5個主要部分,即斷點1到5(BP1~BP5)。BP1~BP2與Bumside-Butler綜合征有關(guān);BP2~BP3缺失是大多數(shù)Prader-Willi/Angelman缺失的原因;BP4~BP5則含蓋了15q13.3缺失綜合征的一部分。15q11.2q13.3區(qū)域包括某些“大腦基因”;不平衡易位常伴隨自閉癥。1.15q11.2缺失即Bumside-Butler綜合征,也稱15q11.2BP1~BP2微缺失綜合征。最小缺失區(qū)域也包含NIPA1、NIPA2、CYFIP1和TUBGCP5基因。盡管缺失片段大小不同(從0.25到1.5Mb,最常見的是0.5Mb),但只有這4個基因發(fā)生了丟失。這4個基因中的任何1個都可能與缺失導致的神經(jīng)行為表型有關(guān)。原來認為該片段不受遺傳印記影響,但在TUBGCP5中檢測到來源于親本的甲基化差異,則表明可能有親本來源效應。背景人群攜帶率可能高達0.25%(400人中有1人),在神經(jīng)行為表型中,大約是0.57%。臨床表現(xiàn)很大程度上局限于神經(jīng)認知/行為/精神表型:學習受到影響,特別是在閱讀和寫作方面。常見的還有注意缺陷和多動,也可能是對立違抗癥,是自閉癥兒童最常見的細胞遺傳學疾病之一;還有精神分裂癥的風險。這種染色體失衡是不完全外顯的微缺失/CNV異常的典型例子。通常是一種遺傳性缺失(80%~85%),但50%的父母不患??;其余均為新發(fā)病例?,F(xiàn)在認為,估計的10%外顯率可能偏低,且可能與根據(jù)患者表型評估的嚴格程度有關(guān),換言之,如果觀察到父母有微弱神經(jīng)行為障礙的信息,外顯率可能會更高。當然,也有人反對過度解釋致病性。2.15q11.2q13.1缺失即Prader-Willi(PWS)和Angelman綜合征(AS),是由該區(qū)域缺失引起的,主要是與PWS/AS區(qū)域罕見的丟失有關(guān),也可能是由不平衡易位的傳遞或涉及15號染色體倒位引起的。平衡相互易位的男性攜帶者,其中一個斷點位于15ql3區(qū)域,可遺傳不平衡補體生育缺失PWS的孩子;女性攜帶者可以有缺失AS的孩子。與易位的其他染色體相關(guān)的不平衡相比,可能會產(chǎn)生額外的影響,如一個兒童表現(xiàn)出AS和1P36缺失綜合征的特征,是由這2個區(qū)段的三級單體導致的,母親是平衡易位攜帶者。部分PWS病例是由于Y染色體與15號染色體易位,且在Yp和15ql2ql3處出現(xiàn)斷裂點,PWS區(qū)域缺失,由核型為45型,der(Y),t(Y;15)導致的。反向插入15號染色體的雜合子祖母有攜帶者兒子,遺傳給患PWS的孫子;還有個攜帶者女兒遺傳給患AS的孫子。PWS/AS區(qū)域的丟失,可能是由于新發(fā)重排引起的,如報道過一個兒童是帶易位t(15;19)(ql2;pl3.3)的PWS患兒。3.15q13.3缺失是在BP4和BP5之間的缺失。較大的(4Mb)缺失可以包括BP3~BP5,較小的缺失可限制在BP4和BP5中。相關(guān)表型本質(zhì)上是神經(jīng)精神病的表現(xiàn)。各種臨床表現(xiàn)的比例不同,智力殘疾為58%,癲癇為28%,言語發(fā)育不良為16%,自閉癥譜系障礙為11%,精神分裂癥為10%,情緒障礙為10%,注意力缺陷多動障礙為7%。癲癇、智力缺陷、孤獨癥和精神分裂癥的比例最高。有報道認為,非語言智商的平均為60分,1/3的病例符合自閉癥譜系障礙的診斷標準。約85%的病例是遺傳的,在被研究的62名父母中,盡管沒有一人患有精神分裂癥,但有一半診斷出患有神經(jīng)精神異常;被研究的精神分裂癥患者都是先證者。也有不完全外顯率和可變表達的分子染色體失衡的例子。在23838名成人對照中沒有發(fā)現(xiàn)病例,這表明外顯率實際上很高。就表型而言,關(guān)鍵因素是缺失片段內(nèi)的CHRNA7基因單倍劑量不足。在一個患兒細胞中發(fā)現(xiàn)了15ql3.3缺失,并發(fā)現(xiàn)了基因的新發(fā)突變,該患兒不能說話,臨床表型相當嚴重。4.15q24缺失這種不平衡的斷點大部分有5個低拷貝重復,斷點(BP)用A到E表示。這些低拷貝重復可以促進非等位同源重組,最常見的是BPA-D處3.1Mb缺失?;蚪M的多種變異導致了多種表型。許多人的言語發(fā)展受到嚴重影響,有些人是聾啞,有的是注意力缺陷多動癥。面部畸形是輕度或“微弱”的,常見寬大的額頭。SIN3A基因可能是關(guān)鍵致病原因。目前無家系遺傳的報道。5.15q25.2缺失一部分缺失是重復性缺失。缺失兩側(cè)都有GOLGA6序列。其他缺失向2個方向延伸。在共同片段內(nèi)有幾個可能的候選基因中,CPEB1基因可能在神經(jīng)認知異常發(fā)生中起作用;并發(fā)癥是Diamond-Blackfan貧血。所有案例都是新發(fā)變異。6.15q26.3缺失這個末端缺失片段的長度不一,其表型特征是生長遲緩,身高和體重通常低于平均值。這提示位于該片段內(nèi)的生長因子IGFR2基因缺失;典型的特征是智力障礙,有些患者可能會入學,但需要特殊照顧。根據(jù)《染色體異常與遺傳咨詢》內(nèi)容編輯
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月29日1123
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常染色體缺失的遺傳咨詢(十)10號染色體缺失
1.10p12.1p11.23缺失10號染色體短臂近端臂內(nèi)缺失是最近才發(fā)現(xiàn)的。所有的缺失長度從0.5Mb~10Mb不等,在p12.1有1.1Mb的關(guān)鍵區(qū)域。在該區(qū)域內(nèi)有兩個亞區(qū)域,決定了該綜合征中隱睪癥(MKX基因是關(guān)鍵致病基因)和顱面部畸形(BAMBI可能是關(guān)鍵致病基因)。不同的畸形反映了缺失位置的不同。在存活的攜帶者中,發(fā)育遲緩是普遍現(xiàn)象。2.10p14缺失即“HDR”綜合征,又稱Barakat綜合征。HDR綜合征包括3種表型:甲狀旁腺功能減退、耳聾以及腎發(fā)育不良。這些表型是由于GATA3基因發(fā)生了缺失或點突變所致。旁邊一個基因的缺失產(chǎn)生了單倍劑量不足,導致了更多的表型,包括嚴重的精神遲滯。該缺失可以向近端延伸到pl4位置或更遠,甚至可延伸到短臂末端。若向絲粒延伸的缺失,會使10pl4區(qū)段發(fā)生缺失;該區(qū)域是DiGeorge樣綜合征的關(guān)鍵區(qū)域,即DSG2區(qū)域,但未發(fā)現(xiàn)哪個基因與該疾病緊密相關(guān)。DiGeorge樣綜合征的表型差異性較大。10pl4缺失以散發(fā)的形式發(fā)生(個別家族性的,是由于插入易位的分離異常導致的)。3.10p15缺失即DeScipio綜合征。該綜合征是新的綜合征,在2012年才證實。該缺失大致分為2類:第一類限制在p15.3范圍內(nèi),該區(qū)域只包含2個基因,ZMYND11和DIP2C。缺失的大小達64kb,一些是臂內(nèi)缺失,最小片段為154kb。第二類是延伸到更遠的區(qū)域,可延伸到p15.2,有的延伸到p15.1;片段大小是1.11Mb-4.0Mb。主要的臨床表現(xiàn)為典型的嚴重的神經(jīng)認知缺陷,常伴隨與大腦皮質(zhì)異常,可導致肌張力障礙的腦性癱瘓。缺失片段大小不同與表型差異無關(guān),這表明ZMYND11和DIP2C基因是核心表型的關(guān)鍵基因。幾乎所有病例都是新發(fā)突變(有2例已知的或者推測是母親遺傳的)。5.10q22.3q23.2缺失該缺失罕見。臨床表型無特異性,包括面部畸形,大多數(shù)語言發(fā)育遲緩。位于10q23.2區(qū)域的BMPRIA基因是核心表型的致病基因;如果缺失延伸至更遠的10q23.2并導致PTEN基因缺失,則可以預測會表現(xiàn)青少年息肉綜合征以及Banayan-Zonana綜合征的特征(罕見)。大多數(shù)10q22.3q23.2缺失病例是新發(fā)變異(有2例是母親遺傳的)。6.10q25.3q26.13缺失如果缺失涉及10q26.11區(qū)域的EMX2基因,則該缺失綜合征與性發(fā)育障礙顯著相關(guān),且XY男性可能出現(xiàn)外生殖器性別不明。有人描述了一個發(fā)育遲緩(包括語言習得障礙)的非發(fā)育畸形兒童,表現(xiàn)為小陰莖、睪丸發(fā)育不良和尿道附近的“苗勒管遺跡”(子宮原基)。有人也報告了一個非常相似的病例,缺失片段稍大,該患者具有獨特的面部畸形。如果缺失范圍擴展到10q26.13可涉及到CTBP2基因,該基因是泌尿道發(fā)育異常的候選基因,在其近1Mb的區(qū)域缺失,可能與頭骨發(fā)育異常風險增加相關(guān)。其他基因的缺失可導致表型更具多樣性。7.10q26.2q26.3缺失10q的遠端的末端缺失被限制在10q26.2q26.3區(qū)域內(nèi),有的缺失也會延伸到10q25.3q26.13。也有部分缺失延伸到更近端,如10q-綜合征。這些限制在10q26.2q26.3末端區(qū)帶的缺失,其表型為中度智力缺陷、生長滯后和輕微的面部畸形。神經(jīng)行為相關(guān)表型變化很大,部分患者表現(xiàn)為注意力不集中或者多動癥。位于該區(qū)域的CALY基因可能是關(guān)鍵基因。有人注意到手和腳表現(xiàn)出明顯的共濟失調(diào)和充血。也有人報道了一個家系,母親和2個女兒都是攜帶者;還有一個家族兄弟2人攜帶者的缺失,均為一個攜帶10p15.3q26.2的母親傳遞。根據(jù)《常染色體異常與遺傳咨詢》內(nèi)容編輯
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月26日396
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常染色體缺失的遺傳咨詢(九)9號染色體缺失
1.9pl3.3pl3.1缺失?該區(qū)域的缺失非常罕見,表現(xiàn)為方形臉(極易辨識)伴隨學習障礙;震顫也是一個重要表現(xiàn)。該區(qū)域內(nèi)沒有一個基因是明確的候選基因。該缺失為新發(fā)突變。2.9p24p22缺失?即9p缺失綜合征,又稱Alfi綜合征。涉及該區(qū)域9p缺失的較多,是一類表型特征。許多患者的缺失發(fā)生在9p22.3區(qū)域內(nèi),缺失長度為5Mb左右,是該缺失的關(guān)鍵位置。三角頭畸形是典型的顱面畸形,與FREM1缺失有關(guān);腦部異常是大腦主要腦溝的外側(cè)裂擴大。這種缺失發(fā)生在父系或母系9號染色體上的概率相同。該缺失向任何一個方向發(fā)生延伸的缺失,看似簡單的缺失,其實的是更復雜的重排。如果缺失的范圍擴大到9pter并導致9p24.3缺失,性腺就會表現(xiàn)出一些癥狀(見9p24.3缺失)。3.9p24.3缺失該缺失發(fā)生的位置比9p缺失綜合征的關(guān)鍵位置更靠近末端。該缺失的一個重要性是發(fā)現(xiàn)了DMRT1基因。在眾多性別決定基因中,該基因最保守。在鳥類,該基因位于Z染色體上(同源配子染色體)。該基因在男性胚胎上比女性胚胎表達量更高,這個表達劑量是誘導睪丸形成的基礎。片段缺失使DMRT1等位基因缺失1個,導致該基因產(chǎn)物低于閾值,導致46,XY,del(9)(p24.3)核型的人出現(xiàn)不同形式的性分化障礙(尿道下裂至性腺發(fā)育不全或男女“性反轉(zhuǎn)”)?;蜻@種表達的可變性以及某些情況下的非外顯(如男性發(fā)育正常)時,可能反映出其46,XX,del(9)(p24.3)女性原發(fā)性卵巢功能不全,成年早期絕經(jīng),可能是由DMRT1基因單倍劑量不足導致的。在判研卵巢早衰時,需考慮該基因的原因(當然比較罕見)。鄰近基因的缺失,可導致更廣泛的表型、輕微的畸形特征和適度的發(fā)育遲緩,或至少有一種較的低神經(jīng)認知狀態(tài)(與該家族正常水平相比)。4.9q21.13缺失?該綜合征比較罕見,是區(qū)域的RORB基因單倍劑量不足所致。有人研究了一些9號染色體缺失的病例,這些患者的9號染色體出現(xiàn)了染色體破碎(該術(shù)語常用于腫瘤遺傳學中),即多條顯色帶顯示出非常漂亮的染色體結(jié)構(gòu)重排。在一個16歲畸形兒出現(xiàn)了這種結(jié)構(gòu),患兒智商為46。5.9q22.3缺失?該缺失綜合征最顯著特征是9q22.32區(qū)段的PTCH1基因缺失,導致該綜合征出現(xiàn)Gorlin基底細胞痣綜合征的表現(xiàn)。缺失可以延伸到附近染色體的區(qū)帶中。其他方面包括三角頭畸形的顱縫合畸形、腦積水、生長過度、面部畸形(無特異性特征)和智力缺陷。該缺失通常為新發(fā)變異。6.9q34.3缺失?即Kleefstra綜合征。該亞端粒微缺失綜合征會導致嚴重的智力障礙、行動困難、異常面容和多種畸形,是除了lp36和22ql3以外,第3個最常見的亞端粒缺失綜合征。位于該區(qū)域的EHMT1基因是9號染色體上倒數(shù)第2個基因,該基因的單倍劑量不足(或者點突變)導致了該綜合征的主要表型。在患者中,缺失片段的大小變化很大,增加了該病的復雜性。該基因編碼產(chǎn)物Eu-HMTasel對于維持組蛋白的穩(wěn)定性發(fā)揮重要作用;組蛋白是基因組染色體上的重要組成部分。因此,該綜合征是染色質(zhì)重塑相關(guān)的疾病。有報道認為父母的性腺嵌合,會導致后代重復性發(fā)生該缺失,但是絕大多數(shù)缺失是新發(fā)變異。???根據(jù)《染色體異常與遺傳咨詢》內(nèi)容編輯
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月26日478
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常染色體缺失的遺傳咨詢(七)7號染色體缺失
1.7p13缺失GreigCephalosyndactylyPlus綜合征。該尖頭畸形-多指/趾并指/趾綜合征是一種典型的常染色體顯性遺傳疾病,是由GLI3基因突變引起的。該區(qū)域內(nèi)的最大的缺失片段是12Mb。其他基因缺失會導致Greig綜合征合并神經(jīng)發(fā)育缺陷、癲癇發(fā)作和其他異常。該區(qū)域內(nèi)的葡萄糖激酶基因的特異性缺失,導致了年輕人發(fā)生成年人發(fā)病的糖尿病。2.7p21.1缺失即Saethre-Chotzen綜合征。該綜合征大多數(shù)是另一種尖頭并指畸形,是由于7p21.區(qū)域內(nèi)的TWIST基因突變導致;細胞遺傳學包括范區(qū)域的微缺失,除了該基因以外,可能還同時缺失了其他基因,導致更多的表型的出現(xiàn)。在7p21.1pl4.3區(qū)域內(nèi)的一個更大的缺失(13Mb),包括H0XA13基因,會導致更嚴重的Saethre-Chotzen綜合征,合并手-足-子宮綜合征表型。也曾報道過一個這樣的患兒,顱骨缺損表現(xiàn)為顱骨早閉;該部位的重復(“三倍劑過多”)會產(chǎn)生相反的效果,即顱骨發(fā)育不全.3.7p22.3p22.1缺失在7p最末端的缺失非常罕見。有人總結(jié)后指出僅9個病例(其中5個的缺失延伸到了7p21或者7pl5);還有一個缺失是新發(fā)突變,位于7p22.2p22.3缺失,長度為0.3Mb。該患者表現(xiàn)為復雜的心臟畸形,研究者推斷這些片段中包括了心臟缺陷相關(guān)的基因。但這個片段中沒有一個基因與心臟病有緊密聯(lián)系。推測FTSJ2基因可能心臟缺陷有關(guān)。有人報道了一個新發(fā)突變,位于7p22.1區(qū)域更近端的位置,長度為L4Mb,該患者表現(xiàn)為橈側(cè)發(fā)育缺陷,可能是由于基因單倍劑量不足導致。該患兒也表現(xiàn)為小頭畸形。4.7q11.23缺失Williams綜合征(WS),也稱Williams-Beuren綜合征,大多數(shù)(95%)是由于該區(qū)域內(nèi)的1.5Mb缺失導致;在父母的配子中有相同的發(fā)生概率。對照組捐助者的精子研究顯示,該片段(WS關(guān)鍵區(qū)域,WSCR)的缺失和重復頻率相似,符合NAHR機制7q11.23倒位,包括WSCR(這種多態(tài)在普通人群中約為于6%的),攜帶者父母更易于在減數(shù)分裂時期發(fā)生缺失。雜合倒位攜帶者生出WS的孩子的風險為1/1750,是總?cè)丝陲L險的4倍。(NAHR機制:在一條染色體上的基因片段重復有利于通過DNA序列的插入,使復制區(qū)重復片段的拷貝數(shù)目發(fā)生改變。在正常個體CNV的形成過程中,通過NAHR機制基因組發(fā)生大片段基因結(jié)構(gòu)變異和染色體重排,這就導致了基因組的不穩(wěn)定和一些疾病的早發(fā)。WSCR:威廉斯綜合征染色體區(qū)域為1.55mb-1.8mb,大小取決于NAHR.WS表型的低復制重復,其特點是面部畸形、智力殘疾、彈性動脈病變、身材矮小、結(jié)締組織異常、嬰兒高鈣血癥和獨特的個性和認知特征)神經(jīng)心理學的典型表現(xiàn)是輕度智力殘疾,對陌生人過于友好,缺乏社會判斷力;杏仁核(社會行為和識別情感面部表情的大腦結(jié)構(gòu))發(fā)育異常,可能是這些特征的原因。另一種特殊的大腦結(jié)構(gòu)的異常,即右上縱向束(一個主要的白質(zhì)束),可能是視覺空間缺陷的原因,其中一個常見的例子是從一種地面(比如地毯)到另一種地面(比如地板)的步履猶豫。WSCR區(qū)域內(nèi)缺失的基因包括彈性蛋白基因ELN,該基因是導致瓣膜上主動脈狹窄的原因?,F(xiàn)在編制出了缺失所致的WBS生長指數(shù)(身高、體重、頭圍)變化曲線。同卵雙胞胎患者通常會出現(xiàn)非常相似的表型。下一胎重復出現(xiàn)WS的概率未知(但也不是完全未知)有人描述了兩例重復性病例,其中一例與父源的多態(tài)性倒位相關(guān)。有研究者發(fā)現(xiàn)是7q11.23倒位雜合子WS先證者的家庭成員,考慮進行產(chǎn)前檢查(盡管客觀上風險系數(shù)非常低)。在另外一個病例中,推測母親有性腺嵌合(但未經(jīng)證實)。很少有父母傳遞給子女的病例,有人把這個有挑戰(zhàn)性的問題歸結(jié)于咨詢者自己有性行為障礙。5.7q11.23缺失Distal該缺失剛好比WS缺失的片段要遠,但是都處于同一個區(qū)帶。這兩個缺失導致了不同的臨床表型,包括多種癲癇、認知障礙和神經(jīng)行為障礙。該缺失中關(guān)鍵的基因是HIP1,當缺失范圍更大的時候,可能YWHAG基因也被包括進來,從而對表型造成更多的影響。值得注意的是,該缺失通常是由一個不外顯的父母傳遞而來,先證者表現(xiàn)出來的明顯的癥狀說明可能存在“二次打擊”的可能性。6.7q21.3缺失DLX6和DLX5基因是在DYNC111增強子控制下的肢體發(fā)育相關(guān)基因。SGCE基因編碼肌聚糖。這些相鄰的基因的缺失,分別導致手/腳分裂畸形及肌張力障礙。2個相鄰基因的同時缺失會使表型擴大。有人描述了一個家庭中有1Mb的缺失,包含了DYNC111(DLX5和DLX6基因是完整的)以及一些靠近著絲粒的基因(不包括SGCE基因)。在這個家系中,父親和3個兒子表現(xiàn)出不同的智力異常表現(xiàn),其中2個兒子還有缺指。后一項觀察表明DYNC111缺失導致外顯率降低。有人總結(jié)了與肌陣攣性肌張力障礙相關(guān)的7q21.3缺失。他們發(fā)現(xiàn)了一個0.5Mb的缺失,位于SGCE基因旁邊并靠近著絲粒的方向。該缺失可能是一些病人精神遲滯的原因。一個病例是由父親向兒子傳遞的缺失,該兒子IQ為30,12歲時四肢和軀干出現(xiàn)“休克樣”搏動(肌陣攣)。父親并未受到多大影響。該病例中的精神病可能是SGCE基因單倍劑量不足導致。7.7q33q35缺失有人總結(jié)了12個q33q35臂內(nèi)性缺失的病例,大多是新發(fā)突變(除了一例是家族性傳遞)。一個病例有9.9Mb的缺失,包含BRAF基因(生殖細胞的錯義突變可導致后代心面皮膚綜合征;而體細胞突變發(fā)生在某些“癌癥級聯(lián)”疾病中)的缺失。該基因與7q33q35缺失所致的表型之間有什么關(guān)系,仍是一個未解之謎。該片段缺失致智力殘疾、畸形、癲癇易于感染。8.7q36qter缺失HoloprosencephalyPlus綜合征。7q末端缺失幾乎都會有q33qter缺失,更多的是q36qter缺失。前腦無裂畸形是一種發(fā)育性腦缺損,其程度從嚴重到較輕不等,有幾種不同的遺傳原因。該區(qū)域內(nèi)的關(guān)鍵表型基因是SHH,為不完全外顯。該缺失通常是新發(fā)突變,但是遺傳性前腦無裂畸形,曾出現(xiàn)在7q36易位的家系中。該缺失導致的認知相關(guān)表型非常嚴重。根據(jù)《染色體異常與遺傳咨詢》內(nèi)容編輯
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月25日246
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常染色體缺失遺傳咨詢(五)5號染色體缺失
1.5p缺失即貓叫綜合征。該綜合征大部分是末端缺失,長度變化很大。臨床嚴重程度與缺失片段的大小基本一致。哭聲似貓叫是最明顯的特征,聽見這樣的哭聲,不用看見患兒的面容,就可懷疑該綜合征可能。與表型相關(guān)的區(qū)域在5p632中的700kb范圍內(nèi),含2個基因(ADAMTS16及ICE1),其他表型可能是由5pl5其他某個片段導致的。更多的人是在更遠端(5p15.31pter)的小缺失攜帶者,有典型的輕/中度認知障礙;5pter-5p14.1區(qū)域缺失,可導致中度到重度的認知障礙;當缺失的范圍延伸到5pl3.2pl3.3之后,則表型變得更加嚴重。智力正常者十分罕見。絕大多數(shù)病例是散發(fā),大約10%是來自家族性的易位。另一種罕見的原因是父母攜帶一個大片段的倒位。一例在產(chǎn)前診斷中發(fā)現(xiàn)5p15.2缺失,后證實父親是性腺嵌合體。從父母遺傳的缺失者很少見,且表型較輕;斷點處于遠端者較常見。這些攜帶者父母有認知缺陷和行為異常的表型。值得注意的是,一位5p缺失的父親,小時哭聲像貓一樣,學習困難,卻最終獲得了計算機科學學士學位。2.5ql4q21,5ql4.3缺失該缺失與Rett綜合征有些相似,5q14.3區(qū)域內(nèi)的MEF2C基因是導致表型的關(guān)鍵基因。表型特征是嚴重的智力障礙,與大腦畸形有關(guān),有簡化腦回模式的小頭畸形。缺失可以很小,只有MEF2C基因缺失,攜帶者統(tǒng)稱5q14.3綜合征。大多數(shù)缺失的長度為1~10Mb,泛稱5q14q21。3.5q22q23缺失即PolyposisPlus綜合征。該綜合征非特異性特征是輕微的面部畸形及輕度到中度的精神發(fā)育遲滯;另一個特征是腸腺瘤性息肉病。正是該缺失促進了APC基因的發(fā)現(xiàn)。單獨APC一條等位基因的缺失,便會導致息肉;另一條完整的5號染色體上APC基因再有任何突變或者缺失,都會導致該基因喪失腫瘤抑制的功能。5q22q23缺失除了導致先天性異常外,還有“第二次打擊”作用,即可以使其他類似微缺失的病例有癌變傾向。典型的情況是,缺失染色體上的腫瘤抑制基因的一個等位基因的缺失,構(gòu)成了腫瘤發(fā)生過程中的“第一次打擊”。有人描述了一個10q22.3q24.1缺失的多發(fā)性先天性畸形和青少年息肉病患者,后一個表型反映了PTEN基因的雜合丟失。9q22.32q31.1缺失與“Gorlin綜合征plus“表型相關(guān),同時患癌癌風險增加。有人發(fā)現(xiàn)一個新發(fā)的2pl6p21缺失,導致一個女性的輕度畸形和中度的智力遲鈍,在37歲時出現(xiàn)腸癌,最后確認是由于錯配修復基因MSH2的結(jié)構(gòu)性缺失。4.5q31.2q31.3缺失這種罕見的缺失綜合征的臨床表現(xiàn)主要是神經(jīng)發(fā)育異常,伴有嚴重的智力缺陷、明顯的張力減退、呼吸暫停和喂養(yǎng)困難。新生兒期可出現(xiàn)異常運動,類似于癲癇發(fā)作,但在腦電圖上沒有癲癇活動;腦MRI顯示額葉結(jié)構(gòu)不良。有報告該綜合征患者活到了26歲,是已知年齡最大的患者;其缺失片段約l~5Mb,內(nèi)有2個不重疊的小缺失(360kb及0.9Mb),在該缺失區(qū)域的PURA基因及LRRTM2基因為關(guān)鍵致病基因。推測有2個“亞綜合征”:一個是PURA丟失導致,一個是LRRTM2缺失導致。大多數(shù)l5q31.2q31.3缺失中包括這2個基因。所有病例均為新發(fā)突變。5.5q35.3缺失即Sotos綜合征。對Sotos綜合征(巨腦癥)的遺傳學研究發(fā)現(xiàn)了一個奇怪的現(xiàn)象,大約一半的日本病例是由于5q35.3的微缺失導致,英國人群只有10%(其余的人有NSM點突變)。英國人的缺失長度從0.5到5.0Mb;在日本。大多數(shù)人的缺失是重1.9Mb。這些差異可能反映了“基因組結(jié)構(gòu)”的種族異質(zhì)性,特別是側(cè)翼低拷貝重復,容易導致發(fā)生重排。大部分缺失發(fā)生在父系染色體上。還有更多的5q35缺失,其中可能包括5q35.1和q35.2區(qū)段。根據(jù)《染色體異常與遺傳咨詢》內(nèi)容編輯
竇肇華醫(yī)生的科普號2023年09月23日440
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